按行业进行划分
1.工程类项目管理软件。主要指应用在诸如建筑工程、装饰工程、水利电力工程等工程类型中的项目管理软件，项目管理软件的应用价值为，在工程前期、过程中、后期分别对物料、设备、成本、工期等方面进行预估、分配、把控、调整等操作，以达到工程能在预期内完美落地的效果。
2.非工程类项目管理软件。是针对工程项目管理之外的企业中涉及对人员、跨部门项目类事务的管理，例如研发项目管理、销售项目管理、市场项目管理等。因此，工程类项目管理软件与非工程类项目管理软件在软件功能上有本质差异。
按企业发展
1.成品套装的项目管理软件
这类系统是定型的项目管理软件，通过软件的参数设置，对软件做少量的功能调整。无法解决的管理需求，通过二次开发实现，系统主体架构不可变化，只能解决一部分的新增需求，同时，二次开发可能引发系统不稳定现象。此类软件灵活性差，系统更新速度缓慢，但成本较低，应用速度较快。
2.在开发型平台上研发的项目管理软件
此类项目管理软件类似于伙伴协同办公平台，它是在某开发平台上按用户需求来设计开发。其质量受制于研发人员的业务理解能力和业务经验，企业亦可组建研发团队研发适合自己的项目管理软件，成本略高。
3.应用设计平台下的项目管理软件
此类系统按照用户需求进行个性化设计，包括管理表单、管理功能、业务流程、数据查询、业务报表、用户界面风格等。可应对管理需求的变化，动态调整业务应用和管理流程，解决因二次开发周期过长而带来的管理系统不能与业务变更同步完成的问题。
